По опыту, при попытке ограничить заливку чего нить специфичного на файл сервер (avi, mp3 итд) юзеры просто начинают переименовывать файлы и все... Скриптик который будет убивать через определенное время определенные файлы действительно некая нагрузка на сервак (хотя конечно зависит какой сервак и сколько пользователей).
Стандартными групповыми политиками не пробовал это делать... думаю это и нельзя сделать, хотя кто знает.
Думаю стоит попытать счастья со сторониим софтом типа:
Quota Advisor
Veritas Storage Exec (помоему как раз у него есть такой функционал)